在使用知网硕士查重软件时，首先要确保文档格式正确，最好使用doc、docx等格式进行查重，避免出现乱码或格式错误导致查重不准确。其次，要注意文档内的引用格式和排版，确保文献引用标准规范，避免误判。另外，在提交查重前，建议先对文档进行自查，确保文中无抄袭内容，以免被查重软件误判为抄袭。最后，要及时保存查重报告，以备日后查证使用。

在使用知网硕士查重软件时，需要注意保护个人隐私信息，避免将个人身份信息或其他敏感信息暴露在查重软件中。另外，在使用查重软件时，应注意网络安全，避免下载不明软件或点击不明链接，以免造成信息泄露或电脑感染病毒的风险。此外，应遵守软件的用户协议，不得将查重软件用于非法用途，以免触犯法律法规，影响个人名誉和学术声誉。